Okulumuz 1966-1967 yılında  Zile Ortaokulu  olarak  eğitim-öğretim hizmetine  başlamıştır. Halk arasında Kale Ortaokulu olarak  bilinen kurumumuzun ilk müdürü Lütfi IŞIK' tır.Okul zamanın şartlarına göre eski bir binada eğitim yapmakta, binanın durumu ve barakalar eğitim için hiç elverişli değildi.İşte bu nedenle okul için arsa arandı ve şu anda okulumuzun bulunduğu binanın arsa sahipleri Salim EKEN, Ahmet EKEN ve Lütfiye EKEN, Ömer AKBAY arsalarını okul binası için Milli Eğitim Bakanlığına devrettiler.Bakanlık da bu arsa üzerine binayı yaptırarak 1970-1971 eğitim-öğretim yılında okulu hizmete açtı. Zile' ye yapılan iki ortaokulun isimleri de halk arasında fazla rağbet görmemesi üzerine 1970 Malazgirt Zaferi´nin 900. yüzyılı nedeniyle okulumuza Alparslan Ortaokulu adı verildi.

  Okulumuz 1997-1998 eğitim-öğretim yılında ilköğretim kapsamına alınarak Zile Alparslan İlköğretim Okulu adını almış,2004-2005 eğitim-öğretim yılında ise okul bahçesine yapılan 120 kişilik pansiyon nedeniyle de Zile Alparslan Yatılı Bölge Okulu statüsüne kavuşmuştur.2012 yılında pansiyon kapatılarak İlköğretim Okulu olarak eğitimine devam etmiştir.

  Okulumuzda sırasıyla Lütfi IŞIK, Musin DEMİRCİ, Ömer SELVİ, Mustafa  ALKAN, Mehmet TÖRÜN, Selahattin KOCAMAN, Ahmet OCAKÇIOĞLU, İsmet ÖZTÜRK  görev yapmışlardır. 2010 yılında uygulanan rotasyonla okul müdürlüğüne Ahmet OCAKÇIOĞLU yeniden atanmıştır.

    2012 yılında yapılan değişiklikle okulumuz, 2012-2013 eğitim-öğretim yılından itibaren ortaokul olarak faaliyetine devam etmektedir. 2014 yılında Ömer MERT okul müdürlüğüne başlamıştır. 2019 yılında Şamil AKINCI okul müdürlüğüne atanmış olup, halen görevine devam etmektedir. 2015 yılından itibaren sadece gündüzlü öğrencilerle eğitim öğretime devam etmektedir.